官署名。简称侍卫马军司或马司。北宋初分侍卫亲军马步军都指挥使司而置，与殿前都指挥使司、侍卫亲军步军都指挥使司合称三衙，分掌全国禁军之统领，兼总厢兵，统兵官为侍卫亲军马军都指挥使、侍卫亲军马军副都指挥使和侍卫亲军马军都虞候，各一员，掌禁军马军诸指挥之名籍，总其政令，侍卫扈从及大礼宿卫; 所领马军，自龙卫而下有左右四厢都指挥使，龙卫左右厢各有都指挥使; 每军有都指挥使、都虞候，每指挥有指挥使、副指挥使，每都有军使、副兵马使、十将、将、虞候、承勾、押官。南宋专掌直隶本司之军，地位与御前诸军平列，置主管侍卫马军司一人，其属有干办公事、准备差遣、点检医药饮食各一人，掌出戍建康;差主管机宜文字一人，掌马军之政令; 有巡防敕应，则纠率差拨龙卫四厢隶焉。辽朝南面官，以侍卫亲军马军都指挥使掌领; 南京亦置，以马军都指挥使掌领，地位远逊于前。

官署名。北宋设置，掌马军诸指挥之名籍，凡统制、训练、番卫、戍守、迁补、赏罚之政令皆总之。设官有都指挥使、副都指挥使、都虞候各一人，所领马军，自龙卫以下左右厢又各有都指挥使。南宋时本司只辖驻扎临安府之马军。为屯驻大军之一支，后又移驻建康府。设主管侍卫马军司公事一人以主管之。其属有干办公事，准备差遣、点检医药饭食等员。