1911年（清宣统三年）10月武昌起义胜利后，依据同盟会的《革命方略》，成立湖北军政府。设都督一人，下设司令（亦称军令）、军务、参谋、政事四部。司令部设总长一人（由都督兼任）、司令官若干人、收掌员二人、书记员四人、传达员四人；军务部设部长一人、副长一人及总务、军事、人事、军需、经理、执行、医务等七科；参谋部设参谋长一人、副长二人、参谋官若干人；政事部设部长一人、副长一人及外务、内务、财政、司法、交通、文书、编制等七局。以后取消政事部，军政府改设军令、参谋、军务、内务、外交、理财、交通、司法、编制九部，并设总监察部及秘书、顾问、稽查等处。南北议和期间又增设实业部和教育部。此后，湖南、云南及上海等省市的军政府组织略同。
1917年孙中山在广东组织的*护法军政府。
